الاختراق والتسلل إلى أية مجموعة يكون أقوى بكثير من التواجد الفيزيائي، وهذه القضية أثبتت صحتها في جميع الحروب. في جيش سيدنا علي رضي الله عنه، تسللت مجموعتان من المنافقين.
1. الروافض بقيادة عبد الله بن سبأ اليهودي
2. الخوارج بقيادة عبد الله بن وهب الراسبي
هؤلاء كانوا من عدد قليل ومحدود من الأشخاص الذين تسللوا في جيش سيدنا علي رضي الله عنه.
الخوارج كانوا في الأصل من المسلمين الأوفياء في جيش سيدنا علي رضي الله عنه، لكن بسبب نفوذ المجموعات المنافقة وخداعهم، انقسموا إلى مجموعات عديدة وثاروا ضد الخلافة الإسلامية.
سيدنا ابن عباس رضي الله عنه حاول إقناع الخوارج بالقرآن والسنة، فاقتنع بعضهم وتركوا الثورة، لكن مجموعة أخرى بقيادة عبد الله بن وهب الراسبي أصبحت أشد عنادًا وزادت في تمردها يومًا بعد يوم.
نظرًا لأن سيدنا علي كرم الله وجهه خاض تجربة حرب صفين وقتال الإخوة، ولم يكن يريد أن يُسفك دم المسلم بيد مسلم آخر، فقد حاول بكل السبل الممكنة الوصول إلى السلام والاتفاق.
أرسل سيدنا أبو أيوب الأنصاري رضي الله عنه، ثم أرسل سيدنا حرب بن مره العبدي رضي الله عنه للمفاوضات والدعوة، لكنهم لم يلقوا بالًا واستمروا في غرورهم حتى قتلوا حرب بن مره رضي الله عنه بوحشية، وعندما كان سيدنا علي رضي الله عنه في طريقه إلى الشام، قتل الخوارج عبد الله بن خباب بن الأرت رضي الله عنه وزوجته الحامل.
لم يقبلوا عقيدتهم التكفيرية، وفي النهاية أدى ذلك إلى أن يبدأ سيدنا علي رضي الله عنه الحرب ضدهم، وأعد جيشًا كبيرًا للقضاء عليهم، وألحق بهم هزائم قاسية في معركة النهروان.
في هذه المعركة، كان حوالي 68 ألف جندي مع سيدنا علي رضي الله عنه، ومن خلال تكتيك خاص، تمكنوا من تدمير معظم تقدم الخوارج، وفر القليل منهم الذين لم يُقتلوا، ولم يستشهد من جيش سيدنا علي رضي الله عنه سوى 7 أشخاص في سبيل الله جل جلاله.